新版TCGA数据库-数据下载方法

bioinfoclub 生信随笔 2016-12-31 10 次浏览
    自从TCGA更新之后,想必大伙儿对TCGA数据的使用有些懵逼。我作为一枚生信小白,一直苦苦寻觅TCGA的下载方法与处理方法,本文将针对新版的TCGA数据下载方法进行研究,后续将花时间把TCGA数据处理方法。下载:gdc-client....

生物信息学博客与论坛推荐

bioinfoclub 生信随笔 2016-09-22 526 次浏览
  学习生物信息学,你可以从书本中学,也可以通过阅读前辈们的博客来升华自己,当然最有效的方法是接触课题,一波一波的实战。以下推荐一些生物信息学相关的博客网站与论坛网站。生信相关的博客: 生信菜鸟团   ...

那些年在生信路上所经历的彷徨

bioinfoclub 生信随笔 2016-09-17 301 次浏览
【从排斥到接纳】说来学习生信是出于一种偶然,最早,我报考福建医科大学,所选的专业是麻醉学,立志想当一个优秀的麻醉师。现实是差了1分(高考数学有一题从正确解法的改到错的解法,当时那心情,肠子都悔青了),被调剂到了生信。一...

差异基因识别方法整理

bioinfoclub 工具 2016-09-13 160 次浏览
FC(Fold change)又称“倍数”公式如下   参数解释:   优缺点:   参考文献:T检验SAMRankcompRPPD...待更新....(优点缺点相关参考文献等)

生物信息工具整合(包含在线工具与离线工具)–更新中

bioinfoclub 工具 2016-09-12 336 次浏览
【在线生信可视化工具】    生物信息学分析过程中,除了使用本地的一些软件来实现做图或者其他特定目的操作,常常也会用到一些在线的工具。一些在线工具极大地方便了我们生物信息学研究人员。然而网络上有很多的生物信息学...

文献阅读-Discovery and preclinical validation of drug indications using compendia of public gene expression data

bioinfoclub 论文阅读 2016-09-07 159 次浏览
  这是一篇关于药物重定位的文章,2011年发表在Sci Transl Med,作者Marina Sirota,影响因子大约16点,文章具有很强的临床意义。  药物重定位指的是通过各种手段预测已有药物的新适应症,这篇文章提出了一种系统性计算的方...

生物信息学之python入门

bioinfoclub python 2016-09-05 246 次浏览
  一直想写一份关于自己在python入门学习上的完整笔记,都已经列好提纲了,后来查询网络上是否有类似的博文时,逛着逛着发现rabbit gao 已经写了一份比较不错的python入门语法总结rabbit gao's blog的python (看这博客...

生信入门之perl练习题6道

bioinfoclub perl 2016-09-04 241 次浏览 ,
题目来源:论坛 生信技能树(http://www.biotrainee.com/)  panda姐 沈梦圆 *以及生信技能树 *月亮1.题目:统计文本中的每个单词出现次数并排序            用Per...
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